A primeira área de colonização nas terras do atual município foi a Fazenda Preguiça, no território do município de Jequié. Conhecido inicialmente por Preguiça, a área foi depois nomeada por Arraial da Conceição. Em 1924, através de plebiscito, teve seu topônimo alterado para Aiquara. Município criado, com território desmembrado de Jequié, através Lei Estadual de 12.04.1962, denominado por Aiquara. A sede, formada distrito em 1932, foi elevada à categoria de cidade quando da criação do município. Fonte: cnm.org.br