As origens do município de Amaturá se prendem às de São Paulo de Olivença que remontam à missão de São Paulo Apóstolo. Fundada pelos jesuítas que catequizavam os índios da bacia do rio Solimões, em fins de séc XVII, passadas as disputas entre espanhóis e portugueses para o domínio da região com a vitória destes últimos, a antiga missão de São Paulo Apóstolo, depois aldeia de São Paulo dos Cambebas, vem a ser sede de município, desmembrado de Tefé e com a denominação de São Paulo de Olivença. O território deste experimenta vários desmembramentos dando origem aos municípios autônomos de Benjamin Constant e Santo Antônio do Içá. Em 1968 é enquadrado como área de segurança nacional. Em 10.12.1981, pela Emenda Constitucional Nº. 12 o seu distrito de Amaturá é desmembrado, passando a constituir, junto com território adjacente desmembrado de Fonte Boa, o município autônomo de Amaturá. Fonte: cnm.org.br