Os habitantes primitivos da região em que está assentado o município de Cláudia era povos indígenas kayabi, de língua tupi. Com os encontros desafortunados com os brancos, mormente seringueiros, o povo kayabi desertou da região. Hoje se encontra disperso, mas com uma parte localizada no Parque Nacional do Xingu e n Área Indígena Kayabi, na margem esquerda do Rio Tatuí, no município de Juara. O povoamento propriamente dito, do território que constitui o município de Cláudia, surgiu em sua maior extensão de um projeto de colonização indicado em meados de 1978, A empresa Sociedade Imobiliária Norte do Paraná S/A - SINOP, foi a responsável, e tomou como sede um plano piloto de colonização o sítio de Sinop. A primeira missa rezada no município ocorreu no dia 06 de dezembro de 1978, celebrada pelo padre João, com auxílio da irmã Edite. No dia 15 de dezembro do mesmo 1978, a Congregação Cristã no Brasil celebrou o primeiro culto evangélico na incipiente comunidade. A 25 de maio de 1985, através da Lei Municipal n.º 48/85, oficializada pela Lei Estadual n.º 5.054, de 01 de setembro de 1986, foi criado o distrito de Cláudia, ainda com termo jurisdicionado ao município de Sinop. O progresso de Cláudia continuou acelerado, o que motivou as lideranças a lutarem pela emancipação total. Após levantamento de dados e realização de um plebiscito, que foi totalmente favorável a proposta de emancipação, foi publicada a lei que tornava o município. A Lei n.º 5.319, de 04 de julho de 1988, de autoria do deputado estadual José Lacerda e sancionada pelo governador Carlos Gomes Bezerra, criou o município. "Artigo 1º - Fica criado o município de Cláudia, com sede na localidade do mesmo nome, desmembrado dos municípios de Sinop, Itaúba e Marcelândia. Artigo 2º - O município, ora criado, é constituído de um só distrito, o da Sede... Artigo 3º - O município, ora criado, será instalado com a posse do prefeito, vice-prefeito e vereadores, cuja eleição será simultânea com a daqueles municípios já existentes." A instalação do município deu-se em 1º de janeiro de 1989. O primeiro prefeito do município foi o Sr. José Augusto Formigoni (PTB), sendo vice o Sr. Acássio Guzzo (PMDB).