Chamou-se primeiramente São Sebastião da Encruzilhada, depois Encruzilhada, quando, então, se desmembrou de Baependi com a criação do Município de Cruzília em 27 de dezembro de 1948. Os primeiros habitantes foram faiscadores e garimpeiros oriundos da Província de São Paulo, e exploravam ouro nas margens dos córregos da região. Depois foram chegando agricultores e senhores de escravos. Em 1858, numa colina chamada Serrinha, o capitão Manoel Domingos se estabeleceu e, segundo a tradição foi-se originando o povoado. Em 15 de agosto de 1862, consagrou-se a primeira capela com o nome de São Sebastião. Em 14 de novembro de 1873, passou a distrito, subordinado ao município de Baependi. Um ano depois construiu-se a paróquia. Em 1929, o coronel Cornélio Maciel, então vereador de Baependi, fez instalar na localidade uma pequena usina hidrelétrica.