Os habitantes primitivos do território que hoje constitui o município de Indiavaí eram índios bororó, denominados pelos paulistas de índios Cabaçais, numa referência à região banhada pelo Rio Cabaçal. Os contatos indiscriminados exterminaram o povo boróro da região. Hoje em dia não se encontra índio em forma organizada de vida no município. A primeira notícia que se tem de branco na região, vem de 1746, quando o sargento-mor João de Souza Azevedo, descendo o Rio Jauru e subindo o Sepotuba, alcançou o grande divisor das águas. Prata/Amazonas e foi descendo os rios até Belém no Pará. A região foi movimentada por conta dos movimentos poaeiros e de seringueiros, sem que, no entanto tenha ficado memória escrita dos tempos de extração vegetal. A tomada de posse efetiva da região, com colonização e crescimento populacional teve início recentemente, com o estabelecimento da fronteira agrícola mato-grossense. A partir de 1948, o governo do Estado de Mato Grosso estabeleceu leis, desencadeando um surto de colonização de grandes proporções. A primeira denominação do atual município foi água Suja, numa referência ao curso d'água que corta o núcleo urbano e que tem este nome devido à coloração da água. O termo Indiavaí, sugerido posteriormente, tem a intenção de dar referência históricas e geográficas da localidade antes de sua colonização pelo elemento "dito civilizado", já que era habitado por povos indígenas. A prefeitura municipal forneceu um documento dando a seguinte significação ao termo "INDIAVAÍ nome de origem indígena, que significa: INDI (índia) e AVAÌ (feia). No entanto, esta informação carece de estudo mais aprofundado. Após algumas pesquisas concluímos o seguinte: INDI é termo que não existe, acrescentando-se a vogal "a", teremos INDIA, que vem a ser feminino de índio, não é termo de origem indígena, e sim de origem inglesa "indian", advinho do topônimo Índia, relativo ao Mar das Índias exaustivamente procurado pelos navegantes do século XV. Pesquisando o Dicionário Tupi na Geografia do Brasil - Orlando Bordoni, encontramos os seguintes significados para os termos AVAÌ e VAÌ. O termo AVAÌ, tem origem na língua tupi, significando: AVA (cabelo) + Í (rio), Rio dos Cabelos. O termo VAÍ, também de origem tupi, significa: feio, mau. Após o início do patrimônio de Água, o lugar passou a ganhar fama, vindo gente de diversos lugares, influenciados pela grande divulgação da fertilidade do solo e de produção garantida para quem quisesse plantar. Vieram principalmente paulistas, mineiros e goianos. Água Suja acompanhou o desenvolvimento regional e o movimento colonizador dos anos setenta. Pertencia originalmente ao município de Cáceres. Consolidou-se então o núcleo colonizador, aumentando dia-a-dia a população do lugar com novas famílias estabelecendo-se nas imediações do sítio urbano. A Lei n.º 4.153, de 14 de dezembro de 1979, criou o distrito de Indiavaí, com território jurisdicionado ao município de Araputanga. Antes deste fato, o território fazia parte do grande município de Cáceres. Rápido aconteceu o progresso de Indiavaí, pois já a 13 de maio de 1986, a Lei Estadual n.º 4.998, de autoria da Bancada do PDS e PMDB na Assembléia Legislativa, sancionada pelo governador Júlio Campos, Criava o município: "Artigo 1º - Fica criado o município de Indiavaí, desmembrado do município de Arapuntanga. Artigo 2º - O município criado é constituído de um só distrito, o da Sede... Parágrafo Único - O município somente será instalado com a eleição e posse do prefeito, vice-prefeito e vereadores, realizada de conformidade com a legislação federal." O primeiro prefeito municipal foi o Sr. Antenor Modesto.