Ao que consta, seus primeiros habitantes foram os indígenas pataxós. A colonização branca na área foi tardia. Somente por volta de 1860, já no Império, iniciou-se ali a exploração da madeira, formando um pequeno lugarejo. Durante a guerra do Paraguai, ali se esconderam alguns desertores, levando a localidade a receber o topônimo de Escondido. Posteriormente, com a construção da BR-05 (atual BR-101), a área ganhou grande impulso. A denominação Itamarajú, adquirida quando da emancipação política, significa Rio das Pedras, em homenagem ao rio Jucuruçu que banha a sede do município. Município criado com territórios dos distritos de Escondido (atual sede), de Jucuruçu (atualmente município de Jucuruçu) e de São José do Prado (hoje inserido no território do município de Vereda), desmembrados de Prado, por Lei Estadual de 05/10/1961. A sede ganhou foros de cidade quando da criação do município. Fonte: pfldabahia.org.br

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