A história do município se prende à de Carauari, cujas origens remontam à Tefé. Este último chegou a constituir município com área de 500.000 km2 em meados do séc. XIX. Posteriormente, vieram se processando vários desmembramentos de território, dando origens a municípios autônomos. Assim aconteceu em 1911, com o então denominado município de Xibauá que em 1913, passa a denominar-se Carauari. Este município vem a ser extinto em 1930, mas é restaurado em 1931, de seu território, fazendo a maior parte da sua extensão, a área que hoje constitui Itamarati. Em 10.12.1981, pela Emenda Constitucional no. 12 é criada a Vila de Itamarati mais outros territórios pertencentes a Carauari, acrescidos de área adjacente até então pertencente a Tapauá, passa a constituir Município Autônomo de Itamarati. Fonte: cnm.org.br