O povoamento teve início na segunda metade do Século XVIII, com moradores vindo de São Paulo e da Bahia. Após 1816, quando foram doadas algumas glebas para a construção de uma capela em homenagem ao Senhor Bom Jesus de Lambari, o lugarejo passou a ser conhecido e começou a prosperar. A provisão para uso da Capela do Lambari, filiada à Matriz da Campanha, foi concedida em 1828. Em 1850, foi criada a Paróquia de Águas Virgens da Campanha, com sede inicialmente provisória, e mais tarde oficial (1858), na Capela de Lambari, atual Jesuânia. A posição foi invertida em 1867, quando Água Virtuosas (atual município de Lambari) passou a ser sede da freguesia, e somente em 1870, Lambari readquiriu a sua condição de sede da Paróquia. Em 1901, quando foi criado o município de Águas Virtuosas, o antigo Bom Jesus de Lambari passou, elevado a distrito, a integrar o território da nova comuna. Em1923, por força da lei, passou a chamar-se Lambarizinho, distrito que, suprimido em 1938, foi recriado em 1943, com o nome atual de Jesuânia. Em 27 de dezembro de 1948, foi elevado a antigo distrito de Lambarizinho a cidade, com o nome de Jesuânia, nascendo daí um novo município, constituído administrativamente de um distrito único