A região que atualmente compõe o território do município de Paranaíta, pertenceu primeiramente ao município de Diamantino, passando depois à jurisdição de Santo Antônio do Madeira (atualmente Porto Velho - RO), em 1908 e a seguir à Aripuanã, para depois pertencer ao município de Alta Floresta. O núcleo de colonização surgiu em 1979, de um projeto urbano rural, elaborado pela Colonizadora Indeco S/A O processo colonizatório de Paranaíta sofreu sérias interferências em função de atividades garimpeiras. O ouro descoberto na área de seu domínio ocasionou a vinda de milhares de pessoas de quase todo o país, à procura de riqueza fácil. A Lei n.º 4.352, de 1ºde outubro de 1981, de autoria do deputado Osvaldo Roberto Sobrinho, criou o distrito de Paranaíta, com território no município de Alta Floresta. No dia 4 de maio de 1986, o povo do distrito de Paranaíta votou num plebiscito, que objetivava consultar sobre a viabilidade da emancipação política. O que ouviu-se foi um uníssono "sim". A Lei n.º 5.004, de 13 de maio de 1986, de autoria do mesmo deputado Osvaldo Roberto Sobrinho, criou o município: "Artigo 1º - Fica criado o município de Paranaíta, com território desmembrado do município de Alta Floresta." Artigo 2º O município ora criado é constituído de um só distrito, da Sede. Parágrafo Único - O município somente será instalado com a eleição e posse do prefeito, vice-prefeito e vereadores, realizada de conformidade com a legislação federal." A instalação foi no dia 31 de dezembro de 1986, com a posse do primeiro prefeito, o paranaense Benedito Ferreira da Silva, tendo como vice Odalírio Teixeira Sobrinho. Em outros tempos esta imensa região foi habitada por povos indígenas de diversas nações. Estes povos tiveram problemas com o seringueiros e exploradores da região a partir do início da chamada "Primeira Borracha de Mato Grosso", no final do século passado e início deste.