O início da povoação data de 1852, tendo o capitão Cândido Pereira da Fonseca desmembrado da fazenda Santana, de sua propriedade, a faixa de terra necessária à construção da igreja, que tem como padroeira Nossa Senhora de Santana. A baronesa de Juiz de Fora fez doações à igreja para o seu patrimônio e doou um prédio para a escola pública. Ao ser criado o município de Matias Barbosa em 1923, o distrito de Santana do Deserto passou a integrar esse município, do qual se separou em 1953, quando teve a autonomia municipal. Fonte: almg.gov.br