Os habitantes primitivos da região do atual município de Vera são os povos indígenas denominados xinguanos, habitantes do Parque Nacional do Xingu. Ainda hoje esses povos habitam na região original. Em 1971, 41 índios do povo beiço-de-pau foram transmigrados da margem esquerda do Rio Arinos para o Parque Nacional do Xingu. A região, que se sabe, permaneceu à margem da movimentação dos brancos nos primeiros anos de Mato Grosso. A primeira notícia de branco na região vem de 1819, quando o capitão Antonio Peixoto de Azevedo desceu o Rio Paranatinga em viagem de inspeção, a verificar se o rio poderia favorecer navegação franca. . O fundador do atual município de Vera, Ênio Pipino, era paulista de Penápolis, trazendo consigo a prática de colonização no norte do Paraná, fundando ali dezoito cidades. Nesse mesmo ano de 1971, o padre João Salarini celebrou a primeira missa em Vera. Muito contribuíram para a colonização do lugar, quatro irmãs missionárias do Santo Nome de Maria. O acesso a Vera supunha heroísmo, pois a BR-163 não tinha chegado ainda à região de SINOP. Fazia-se o percurso partindo de Nobres, passando pelas fazendas Rio Novo e Ubiratã. Ênio Pipino abriu 80 quilômetros de estradas com o recurso de sua própria colonizadora. Vera foi inaugurada oficialmente no dia 27 de julho de 1972, com a presença do Ministro do Interior, do governador do Estado de Mato Grosso - José Fragelli, Ênio Pipino, pioneiros e muitas outras autoridades. O progresso de Vera correu constante. A Lei n.º 3.755, de 29 de junho de 1976, elevou a povoação a sede de distrito, dentro do território do município de Chapada dos Guimarães. Com a criação do município de Sinop, pela Lei n.º 4.156, de 17 de dezembro de 1979, Vera passou à jurisdição do novo município. Seguiu-se a luta pela emancipação político-administrativa de Vera. Na campanha pelo município destaque o nome do padre Antonio Heidler, que levantou a primeira igreja de todo os projetos de colonização de Ênio Pipino. A Lei Estadual n.º 5.003, de 13 de maio de 1986, criada pela Bancada do PDS e PMDB na Assembléia Legislativa e sancionada pelo governador Júlio Campos, criou o município: "Artigo 1º - Fica criado o município de Vera, desmembrado do município de Sinop e Paranatinga. Artigo 2º - O município ora criado é constituído de um só distrito, da Sede. Parágrafo Único - O município somente será instalado com a eleição e posse do prefeito, vice prefeito e vereadores, realizada de conformidade com a Legislação Federal." O primeiro prefeito de Vera foi o Sr. José de Lima Cavalcanti - paulista de Mirante do Paranapanema, região que nos dias de hoje destaca-se pelos problemas fundiários e de invasão que apresenta. O município de Vera perdeu expressiva territorial, por ocasião da criação dos municípios de Feliz Natal e Nova Ubiratã. Seu território original era de 26.645,80 Km², que foram reduzidos a 2.986,75 km².